Здравствуйте, Аноним, Вы писали:

...

А>Вопрос 1. Как заставить ifstream правильно читать последовательности CR/LF
Для начала попробуй заменить

std::ifstream in ( argv[1], std::ios_base::in, std::ios_base::binary );

на

std::ifstream in ( argv[1], std::ios_base::in | std::ios_base::binary );

А>Вопрос 2. Как правильно смотреть состояние бинарного потока std::ifstream, чтобы не было чтения "несуществующего байта" ?
Состояние потока меняется после попытки чтения.