веб сервер должен уметь исполнять код, а не просто выдавать голый html. сейчас популярны asp/.Net, php, jsp, perl. у тебя линух значит asp/.Net отпадает, а веб серер наверника апач. для небольших задач php популярнее, значит тебе нужно скомпилить апач с модулем пхп, а пхп скомпилить с поддержкой mssql.