Hello, Sinclair!

УСХ (универсальная структура хранения) тормозить будет нещадно. Пробовали. Но на оракле.
К тому же тут придется делать или эмулировать кросс-таб запросы (не всегда ведь клиента устроит таблица из 2-х столбцов — нужно и группировать). А это уже гораздо хуже статического джойна.
Как я понимаю, заковыка в том, что на этапе проектирования системы все сущности не известны. Т.о. пользователь должен уметь вводить и/или расширять сущности, на основе которых генерируются обычные таблицы. Дальше можно накручивать наследование и т.п.
Для каждого поля нужно определить пользовательский тип (типа домена, но с большей информацией). По полям одного типа и собирается статистика, независимо от того, в какой сущности они находятся. Т.е. при сборе статистики сначала ищутся сущности, которые подходят под описание, потом уже в тих сущностях ищутся объекты.

Это все как вариант.

Тут еще ведь специфика в том, что запросы наверное производятся гораздо чаще, чем модификации, так что одна таблица вряд ли покатит.