Здравствуйте Сан Саныч, вы писали:

СС>Truble 1 таков — JAVA приложение запускает некий процесс ( к примеру юниксовый процесс "ps -ef"), этот некий процес пишет в какойто поток, как из JAVA приложения прочитать из этого потока? Ответье пожалуйста.

СС>Truble 2 таков — есть ли возможность из JAVA приложения получить список всех процессов запущенных на машине и кильнуть некоторые из них? Если есть объясните плиз как это сделать.

Есть такой проект JTop
http://www.anthonyeden.com/projects/jtop/