Qt Creator
PyCharm
GoLand

S>может ли вы помешать файлы конфигурации IDE в source control

Могу помещать, могу не помещать. Непонятен вопрос.

В большинстве случаев этого делать не стоит, тк настройки и предпочтения у всех разные, а все, что касается проекта, можно принести через энвайремент. Но иногда (встречал такое на Java-проектах) туда запихивают много конфигов энвайремента.

Кстати, JetBrain-овские ИДЕ сами прописывают свои конфиги в gitignore.