Б>Откуда менеджер знает, сколько займет реализация?

Менеджер знает содержание договора или приказа (в какой срок нужно сдать заказчику готовую софтину или модуль).

А программист одну и ту же задачу может выполнять и неделю, и месяц (с разным качеством проектирования, программирования, тестирования).