Кстати, я обнаружил, в чем была причина вылетания графа.
Все дело в том, что при использовании FileWriter энкодеры передают AVI Mux'еру сэмплы бОльшего размера. Я не стал разбираться почему, это не так важно.
При замене FileWriter'a на Dump сэмплы уменьшаются и всплывает глюк в одном из энкодеров, который заключается в том, что энкодер выдает два подряд сэмпла, у которых time stamps:
(a1,b1), (a2,b2) и a1 < a2 < b2 < b1.
Я думаю, глюк бы со временем проявился и с FileWriter'ом, на других примерах.