Протоновский GUI это обертка над OpenVPN. Он управляется через telnet подключение к отдельному management порту. Именно так работает и родной GUI, и протоновский. Команды описаны в документации OpenVPN. "Переключение прокси" это отключение от одного хоста и подключение к другому.
P.S. Твои целевые сайты скоро забанят и протоновские хосты. В бесплатной версии их всего несколько и они статические.