Здравствуйте, Lexa-Lexa, Вы писали:

LL>Посмотрел и логи...
LL>При установке через GPO:
LL>SOURCEDIR — PROPERTY CHANGE: Adding SourceDir property. Its value is '\\Server1\Share\RC5\'. — все верно
LL>BASE_SOURCEFileSearch — вообще ни одного упоминания, ну даже не пытается искать что ли?
LL>BASE_SOURCE — есть только это: SecureCustomProperties = BASE_SOURCE;NETFRAMEWORK20;NEWPRODUCTFOUND;UPGRADEFOUND — какой то бред...

Насколько мне помниться установка через GPO проходит в silence mode, то есть InstallUISequence не исполняется.
Подозреваю что у Вас не определено действие AppSearch в InstallExecuteSequence.
В любом случае протестировать такое поведение Вы можете задав опцию qn для msiexec
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa367988.aspx