Здравствуйте, GPFault, Вы писали:

GPF>http://nsis.sourceforge.net/
GPF>не пробовал, но его очень хвалит создатель launch4j (Windows native launcher)

Как сам использующий данный пакет для написания инсталляторов коммерческих программ, скажу, что это предложение весьма разумно. Да, конечно, NSIS не заточен на яву, однако встроенный скриптовый язык легко решает данную проблему. Более того, она фактически решена.
Плюсы:
— Open Source и неплохая выгодная лицензия;
— неплохие примеры и коммьюнити;
— кросс-платформенность.
Минусы:
— все приходится писать ручками;
— нет заточки под определенные фреймворки;
— скрипт немного необычен, но если кто начинал свою карьеру программиста с ассемблера, легко разберется