D>Очень долго бились. Поддержка гугла настоятельно рекомендовала завершать покупку на своей thankyou page (соответственно, со скриптом аналитика). Для этого у PayPro есть редирект.
D>Получилось только так, но только пришлось купить SSL сертификат и установить на домене, что бы редирект с https не выдавал предупреждение браузера.
D>Возможно, есть другое решение, но мы его не нашли.

У нас трекались покупки в пейпро с adwords, по ним даже оптимизация была по CPA.
Деталей не помню, но
— в настройках Paypro есть adwords tracking code
— paypro без всякой настройких трэкает транцации (электронную торговлю)
— нужно в Onclick ссылки покупки добавить _gaq.push(['_link', ... (см доки гугла) и вроде бы setdomianname('none') в коде GA.
— thankyou page тоже была настроена как цель, но сертификат не покупали, странно, то ли тестили не внимательно, то ли проблемы не было...