в
Tools->Options->Projects->VC++ Directories
или в
Project->Options

Суть вопроса заключается в том прописывать ли пути в проектном файле(Project->Options) или в настройках среды, т.е либо жесткая структура расположения папок в проекте(когда участники договариваются о структуре) либо нет.

Важная часть вопроса: разработка ведется не одним человеком а группой. Хотелось бы услышать мнение людей работающих в группе.

Просьба при ответе на этот вопрос говорить какой точки зрения вы придерживаетесь(голосование).