Здравствуйте, Sinix, Вы писали: S>Это by design, или можно как-то бороться?
Надо смотреть на характер конфликта. Простое добавление строк в разные части файла не должно быть конфликтным.
Если добавление идет примерно в одно и то же место и разрешение заключается в выборе порядка следования новых строк — это нормально.
Еще бывает, если студия, помимо собственно добавления строки о файле, меняет что-то еще на свое усмотрение в файле проекта — тут уж к самой студии вопросы.