Конструкция нужна за тем, чтобы после строки кода, где возможно ее возникновение вставить код с обработкой ошибки:
If Err <> 0 Then
WScript.Echo "Error #" & Err.Number & " " & Err.Description
' Здесь можно что-то предпринять ...
WScript.Quit
End If