vsb>При этом достаточно перезапустить docker контейнер и оно со второго раза обычно начинает работать. Но не всегда.

Посмотри внутри докера столько там typeDefs, где лежат и что в них. Чудес не бывает, либо файл не тот либо тот но почему-то содержимое не то.